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La coccidiose aviaire engendre des pertes de plusieurs milliards de dollars à l’échelle mondiale. La maladie causée par le parasite Eimeria affecte la santé digestive et la conversion alimentaire des poulets, est le principal facteur de risque de l’entérite nécrotique et peut mener à des taux de mortalité importants. Depuis les années 70, les médicaments anticoccidiens sont utilisés, mais pour la production biologique, pour se conformer aux réglementations et aux demandes des consommateurs, et pour limiter la résistance aux médicaments, des alternatives médicamenteuses sont nécessaires. Les vaccins se sont développés, mais leur rapport risque/bénéfice n’est pas toujours clair. De nos jours, pour évaluer l’efficacité de leurs produits en développement, les entreprises se tournent souvent vers des challenges coccidiens composés de plusieurs doses de vaccins commerciaux. Cependant, les souches Eimeria retrouvées dans ces vaccins sont des souches parfois atténuées, sensibles aux anticoccidiens, peu virulentes et surtout non représentatives des souches retrouvées dans des poulaillers commerciaux. De plus, la proportion des espèces Eimeria retrouvées dans les doses de vaccin varie de lot en lot. Afin d’évaluer correctement l’efficacité d’anticoccidiens couramment utilisés et de nouveaux produits, ce projet a permis de développer une méthode pour modéliser une coccidiose aviaire représentative des poulaillers commerciaux. Dans cette étude, des souches Eimeria de terrain ont montré une diminution de leur sensibilité à certains anticoccidiens.